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A história se passa em um mundo onde as pessoas continuam a sua guerra contra o "Unknown" - o inimigo da humanidade. As crianças que foram evacuadas para uma instalação de sono frio durante a invasão pelos "Unknown" há várias décadas acordaram de seu sono e aprenderam que seus corpos desenvolveram algumas forças sobrenaturais. A fim de proteger o país do "desconhecido" que emerge da baía do portão de Tóquio, os meninos e meninas travam batalhas na defesa das cidades de Tokyo, Kanagawa e Chiba.